INTEGRATIV RNA-SEQ TAHLILI ASOSIDA SOYA (GLYCINE MAX) VA TOK (VITIS VINIFERA) O‘SIMLIKLARIDA ABIOTIK STRESSIGA CHIDAMLILIK BILAN ALOQADOR GENLARNI ANIQLASH

Yusupov, Abdurahmonbek, Babadjanova, Feruza, Abdullaev, Sadulla, Ziyodulloxon, Hakimullo, Murodov, Anvarjon, Obidov, Nurdinjon, Mamajonov, Bexzod, Ubaydullayeva, Xurshida, Ayubov, Mirzakamol

FarDU ilmiy xabarlari · 2025-yil

Annotatsiya

<p><em>Ushbu tadqiqotda Glycine max (soya) va Vitis vinifera (uzum) o‘simliklarida sovuq, tuz hamda qurg‘oqchilik kabi abiotik stresslarga javoban farqli ekspressiyanuvchi genlarni aniqlash maqsadida bir qator ma’lumot bazalaridagi RNA-seq ma’lumotlari qayta tahlil qilindi. Integrativ bioinformatik yondashuv asosida NCBI ma’lumotlar bazalaridan olingan turli tajribalarga oid transkriptom ma’lumotlar (tok bo‘yicha: PRJNA787359, PRJNA549981, PRJNA788159; soya bo‘yicha: PRJNA852689, PRJNA933767, PRJNA813355) birlashtirildi va standartlashtirilgan pipeline yordamida tahlil qilindi. </em></p> <p><em>Farqli ekspressiyalanuvchi gen (DEG), funksional annotatsiya (GO va KEGG) tahlillari orqali asosiy abiotik stresslar bilan aloqador genlar aniqlandi. Tadqiqot natijalariga ko‘ra, har ikki o‘simlikda qurg‘oqchilikka va past haroratga javoban ekspressiyasi o‘zgaradigan o‘nlab yangi genlar topildi. Aniqlangan genlarning bir qismi ilgari bu stress turlari bilan bog‘liqligi kuzatilmagan. Ushbu natijalar kelgusida marker genlar, genetik modifikatsiya uchun boshlang‘ich material yoki seleksiya uchun muhim genomik resurslar sifatida xizmat qilishi mumkin.</em></p>

Maqola ma’lumotlari
MualliflarYusupov, Abdurahmonbek, Babadjanova, Feruza, Abdullaev, Sadulla, Ziyodulloxon, Hakimullo, Murodov, Anvarjon, Obidov, Nurdinjon, Mamajonov, Bexzod, Ubaydullayeva, Xurshida, Ayubov, Mirzakamol
JurnalFarDU ilmiy xabarlari
Nashr sanasi2025-10-25
Jild31
Son5
TilO‘zbek

Kalit so‘zlar

uzum, soya, RNA-seq, abiotik stess, qurg‘oqchilik, sovuq, DEG, funksional annotatsiya, GO, KEGG, grape, soybean, RNA-seq, abiotic stress, drought, cold, DEG, functional annotation, GO, KEGG

Ilmiy soha

FarDU ilmiy xabarlari jurnalidan boshqa maqolalar

FarDU ilmiy xabarlari — barcha maqolalar